Кроме того, на климат страны накладывают отпечаток ее островной характер, вертикальная расчлененность рельефа и океанские течения. Климат Японских островов не только влажнее материкового на тех же широтах, но и значительно теплее. В летнее время с Тихого океана приходят теплые и влажные ветры.  Лето в Японии душное, дождливое и пасмурное. Даже ночные температуры в большей части страны не опускаются ниже +23-25°C. На побережье неблагоприятное воздействие на организм такого сочетания температур и влажности смягчается донекоторой степени ветрами.Теплое течение Куросио, «японский Гольфстрим», оказывает основное влияние на потепление климата. Североэкваториальное теплое течение дает ответвление в Японское море - между южными островами Рюкю и островом Тайвань проходит теплое Цусимское течение (ширина - 185 км, скорость движения - 3 км в час); основной поток уходит в океан и следует вдоль восточных берегов Японских островов (его ширина - до 500 км, скорость движения - 1-2 км в час). Температура вод Куросио в пределах Восточно-Китайского моря на 3-9°C выше, чем основных вод, и составляет +28°C в августе и +20°C в феврале. Острова севернее 38° широты омываются холодным течением Ойясио, мощность которого особенно усиливается летом, во время таяния снегов в Берингом море. Поэтому в зоне действия Ойясио лето сырое, туманное и холодное. Воздействие двух течений обостряет различия в климате между северными и южными островами и делает его более контрастным, чем это диктует географическое положение. Осадков в Японии выпадает больше, чем на соседних частях материка. Наиболее увлажнены склоны гор, перехватывающие муссонные потоки, наименее - межгорные котловины и берега Внутреннего Японского моря. Важным следствием муссонной циркуляции являются климатические различия между западным и восточным побережьем страны. Летом восточное побережье, подвергнутое тихоокеанскому муссону, имеет повышенные облачность и осадки и более низкие температуры. Слабее увлажнено западное побережье. В июле-августе над островами часто проходят тайфуны, что сопровождается мощной облачностью, сильными и продолжительными ливнями и ураганными ветрами.
  На Японских островах зарегистрировано множество источников термальных вод с температурой не ниже 50°C. Около берегов Японии проходят океанические течения: теплое Куросио и холодное Ойясио. Холодное течение, встретившись с более солеными и теплыми водами, ниже образуя обширную зону смешения полярных и тропических водных масс.
В июле и августе над островами часто проходят тайфуны, быстро перемещающаяся область пониженного давления, в которой возникает круговое воздушное течение против часовой стрелки. Прохождение тайфуна сопровождается низкой облачностью, сильными и продолжительными ливнями обложного характера и ураганными ветрами до 12 баллов. Считается, что Япония лежит на главной дороге прохождения тайфунов, ежегодно 10-15 из них регистрируются в стране Восходящего солнца. Убытки от тайфунов, которые губят посевы и вызывают наводнения, нередко более значительны, чем убытки от землетрясений.